近日，中國農(nóng)業(yè)科學院飼料研究所反芻動物飼料創(chuàng)新團隊，聯(lián)合美國阿肯色大學相關(guān)人員，首次采用機器學習算法FishTaco對早期補飼羔羊瘤胃微生物區(qū)系及其功能轉(zhuǎn)變進行了深度分析研究，發(fā)現(xiàn)了一系列與早期補飼相關(guān)的標志性微生物群體及其與瘤胃發(fā)酵的關(guān)系。該研究有助于完善反芻動物幼畜的培育策略，促進反芻動物產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《微生物（Microorganisms）》上。
據(jù)張乃鋒研究員介紹，羔羊出生后面臨瘤胃功能的建立過程，即從非反芻到反芻功能的轉(zhuǎn)變。早期補飼固體飼料可以顯著促進羔羊瘤胃及其微生物區(qū)系的發(fā)育。然而與早期補飼相關(guān)的標志性微生物及其對瘤胃發(fā)酵功能建立的調(diào)控機制仍不清楚。該研究通過采用Random Forest、Fish Taco及Network analysis等機器學習算法深度分析了瘤胃微生物數(shù)據(jù)及其與瘤胃發(fā)酵功能建立之間的關(guān)系。結(jié)果顯示，早期補飼通過改變標志菌群及其共生菌來調(diào)控核心微生物區(qū)系結(jié)構(gòu)，進而促進VFA的產(chǎn)生和瘤胃功能的轉(zhuǎn)變。
該研究得到國家重點研發(fā)計劃課題和國家自然科學基金資助。（通訊員 張帆）
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