記者18日從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所獲悉,該所作物病毒病害監(jiān)測與防控創(chuàng)新團(tuán)首次揭示,真菌在營養(yǎng)生長階段存在由RNA干擾指導(dǎo)DNA甲基化的全新機(jī)制。這項發(fā)表于國際期刊《核酸研究》的研究,被該刊授予“突破性論文”稱號。
“RNA干擾是一種重要的生物過程,通過小RNA分子來抑制特定基因的表達(dá);而DNA甲基化則是在DNA分子上添加甲基基團(tuán)的表觀遺傳修飾方式,即不改變DNA序列本身但可遺傳的基因表達(dá)調(diào)控方式?!闭撐耐ㄓ嵶髡摺⒅袊r(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所研究員郭立華表示,DNA胞嘧啶甲基化是真核生物中一種高度保守的表觀遺傳修飾,在抵御外來核酸入侵、維持基因組穩(wěn)定性及調(diào)控基因表達(dá)中扮演核心角色。然而,其在真菌日常生存與生長的營養(yǎng)階段如何發(fā)生、有何功能,一直是個未解之謎。盡管動植物研究中已明確病毒DNA甲基化是宿主抗病毒的關(guān)鍵防線,但由于真菌DNA病毒發(fā)現(xiàn)較晚,相關(guān)機(jī)制在真菌中鮮有報道。
研究團(tuán)隊以重要麥類病原真菌——禾谷鐮刀菌及其病毒為研究模型觀察到,禾谷鐮刀菌病毒基因組在宿主營養(yǎng)菌絲中發(fā)生了廣泛的DNA甲基化,其中DNA-C組分片段MeC5的甲基化水平高達(dá)55.87%。深入分析表明,DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DIM2負(fù)責(zé)介導(dǎo)了病毒復(fù)制相關(guān)蛋白基因啟動子區(qū)域的甲基化修飾。“這種甲基化直接抑制了病毒復(fù)制相關(guān)蛋白基因的轉(zhuǎn)錄活性,從而顯著降低了病毒在宿主細(xì)胞內(nèi)的聚集水平。”郭立華說。
團(tuán)隊證實,來源于禾谷鐮刀菌病毒的小RNA能夠精準(zhǔn)指導(dǎo)病毒自身DNA發(fā)生甲基化?!爸陵P(guān)重要的是,這一指導(dǎo)過程依賴于宿主RNA干擾機(jī)制的核心組件——Argonaute和Dicer蛋白。當(dāng)研究人員敲除禾谷鐮刀菌的兩個Dicer或兩個Argonaute基因時,病毒積累量顯著增加,同時宿主菌絲出現(xiàn)生長缺陷、應(yīng)對環(huán)境脅迫的能力下降以及致病力減弱?!惫⑷A說,這一發(fā)現(xiàn)為理解真菌表觀遺傳調(diào)控開辟了新方向,并為研發(fā)靶向病原真菌DNA的RNA藥物奠定了關(guān)鍵理論依據(jù)。
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所供圖)